食後服用と指示されていても、必ずしもそれにこだわる必要はありません。
逆に食後ではお腹がいっぱいで飲んでくれないことがあるので、朝頃・昼頃・夕方頃といった感じで大丈夫です。
また薬を飲ませる時間に寝てしまった場合も、無理に起こす必要はありません。
起きてからで大丈夫です。